Reduced genetic diversity and the success of the invasive peacock bass (Cichliformes: Cichlidae)

Abstract Several species of Cichla successfully colonized lakes and reservoirs of Brazil, since the 1960s, causing serious damage to local wildlife. In this study, 135 peacock bass were collected in a reservoir complex in order to identify if they represented a single dominant species or multiple ones, as several Cichla species have been reported in the basin. Specimens were identified by color pattern, morphometric and meristic data, and using mitochondrial markers COI, 16S rDNA and Control Region (CR). Overlapping morphological data and similar coloration patterns prevented their identification using the taxonomic keys to species identification available in the literature. However, Bayesian and maximum likelihood from sequencing data demonstrated the occurrence of a single species, Cichla kelberi. A single haplotype was observed for the 16S and CR, while three were detected for COI, with a dominant haplotype present in 98.5% of the samples. The extreme low diversity of the transplanted C. kelberi evidenced a limited number of founding maternal lineages. The success of this colonization seems to rely mainly on abiotic factors, such as increased water transparency of lentic environments that favor visual predators that along with the absence of predators, have made C. kelberi a successful invader of these reservoirs.

Resumo Muitas espécies de Cichla colonizaram com sucesso lagos e reservatórios do Brasil desde os anos 1960, causando graves prejuízos à vida selvagem nesses locais. Neste estudo, 135 tucunarés foram coletados em um complexo de reservatórios a fim de identificar se representavam uma espécie dominante ou múltiplas espécies, uma vez que diversas espécies de Cichla foram registradas na bacia. Os espécimes foram identificados com base na coloração, dados morfométricos e merísticos, e por marcadores mitocondriais COI, 16S rDNA e Região Controle (RC). A sobreposição dos dados morfométricos e o padrão similar de coloração impediram a identificação utilizando as chaves de identificação disponíveis na literatura. Entretanto, as análises bayesiana e de máxima verossimilhança de dados moleculares demonstraram a ocorrência de uma única espécie, Cichla kelberi. Um único haplótipo foi observado para o 16S e RC, enquanto três foram detectados para o COI, com um haplótipo dominante presente em 98,5% das amostras. A baixa diversidade nos exemplares introduzidos de C. kelberi evidenciou um número limitado de linhagens maternas fundadoras. O sucesso da invasão parece depender de fatores abióticos, como a maior transparência da água de ambientes lênticos que favorece predadores visuais que, atrelado à ausência de predadores, fez do C. kelberi um invasor bem-sucedido nesses reservatórios.

Reduced genetic diversity and the success of the invasive peacock bass (Cichliformes: Cichlidae) / Diversidade genética reduzida e o sucesso da espécie invasora tucunaré (Cichliformes: Cichlidae)

Abstract Several species of Cichla successfully colonized lakes and reservoirs of Brazil, since the 1960's, causing serious damage to local wildlife. In this study, 135 peacock bass were collected in a reservoir complex in order to identify if they represented a single dominant species or multiple ones, as several Cichla species have been reported in the basin. Specimens were identified by color pattern, morphometric and meristic data, and using mitochondrial markers COI, 16S rDNA and Control Region (CR). Overlapping morphological data and similar coloration patterns prevented their identification using the taxonomic keys to species identification available in the literature. However, Bayesian and maximum likelihood from sequencing data demonstrated the occurrence of a single species, Cichla kelberi. A single haplotype was observed for the 16S and CR, while three were detected for COI, with a dominant haplotype present in 98.5% of the samples. The extreme low diversity of the transplanted C. kelberi evidenced a limited number of founding maternal lineages. The success of this colonization seems to rely mainly on abiotic factors, such as increased water transparency of lentic environments that favor visual predators that along with the absence of predators, have made C. kelberi a successful invader of these reservoirs.

Resumo Muitas espécies de Cichla colonizaram com sucesso lagos e reservatórios do Brasil desde os anos 1960, causando graves prejuízos à vida selvagem nesses locais. Neste estudo, 135 tucunarés foram coletados em um complexo de reservatórios a fim de identificar se representavam uma espécie dominante ou múltiplas espécies, uma vez que diversas espécies de Cichla foram registradas na bacia. Os espécimes foram identificados com base na coloração, dados morfométricos e merísticos, e por marcadores mitocondriais COI, 16S rDNA e Região Controle (RC). A sobreposição dos dados morfométricos e o padrão similar de coloração impediram a identificação utilizando as chaves de identificação disponíveis na literatura. Entretanto, as análises bayesiana e de máxima verossimilhança de dados moleculares demonstraram a ocorrência de uma única espécie, Cichla kelberi. Um único haplótipo foi observado para o 16S e RC, enquanto três foram detectados para o COI, com um haplótipo dominante presente em 98,5% das amostras. A baixa diversidade nos exemplares introduzidos de C. kelberi evidenciou um número limitado de linhagens maternas fundadoras. O sucesso da invasão parece depender de fatores abióticos, como a maior transparência da água de ambientes lênticos que favorece predadores visuais que, atrelado à ausência de predadores, fez do C. kelberi um invasor bem-sucedido nesses reservatórios.

Modelos para avaliação genética da produção de leite no dia do controle nas três primeiras lactações / Models for genetic evaluation of milk yield on the day of control in the three first lactations

Objetivou-se verificar se a utilização do modelo autorregressivo (MAR) é adequada para obtenção de parâmetros genéticos para produção de leite no dia do controle (PLDC) de bovinos leiteiros da raça Gir. Foram analisados 125.191 registros de produções diárias, nas três primeiras lactações, por meio dos modelos de repetibilidade (MREP) e MAR. No MREP, foi considerado o efeito de ambiente de curto prazo; no MAR, foi considerado, também, o efeito de ambiente de longo prazo. Os modelos foram comparados por meio do logaritmo da função de máxima verossimilhança (−2logL) . A herdabilidade estimada pelo MREP foi 0,18; no caso do MAR, as estimativas para primeira, segunda e terceira lactações foram 0,32, 0,28 e 0,26, respectivamente. A estimativa de autocorrelação dos componentes de variância de longo prazo foi próxima de zero, e as de curto prazo foram de alta magnitude para primeira (0,79), segunda (0,79) e terceira (0,81) lactações. Logo, a influência do ambiente de curto prazo dentro de cada lactação não é a mesma. O valor de −2logL mais próximo de zero foi obtido para o MAR (-294.884,7778) em relação ao MREP (-329.266,4810). Assim, o MAR é adequado para obtenção de estimativas de parâmetros genéticos para PLDC nas três primeiras lactações de bovinos leiteiros.(AU)

Aimed to verify if the autoregressive model (MAR) is adequate to obtain genetic parameters for Gyr dairy cattle milk yield on the test day in the three first lactations. Analysis was performed on 125,191 records of daily production of 9,242 cows using repeatability model (MREP) and MAR. On MREP, a long-term environment was considered, on MAR, the short-term environment was also taken into consideration. The models were compared by logarithm of the maximum likelihood function (−2logL) . The heritability estimated using the MREP model was 0.18, while the heritability estimated by MAR for first, second, and third lactations were 0.32, 0.28 and 0.26, respectively. The autocorrelation estimates of the components of long-term variance were close to zero, and those of the short-term were of high magnitude for first (0.79), second (0.79) and third (0.81) lactations. Therefore, the influence of the short-term environment within each lactation is not the same. The value of −2logL closer to zero was obtained for MAR (-294,884.7778) in relation to MREP (-329,266.4810). Thus, MAR is suitable for obtaining genetic parameters estimates for PLDC in the first three lactations of dairy cattle.(AU)

Diagnostic Cytochrome b gene profiles for the identification of paca (Cuniculus paca) bushmeat: implications for the monitoring of illegal hunting and wildlife trade / Perfis diagnósticos do gene Citocromo b para a identificação molecular de paca (Cuniculus paca): implicações para a detecção e monitoramento de caça e comércio ilegal

Abstract Paca (Cuniculus paca Linnaeus, 1766) is the second largest rodent found in Brazil. The quality of the meat and a long tradition of hunting have contributed to the decline of the natural populations of this species. Hunting of paca is strictly prohibited in Brazil, but in spite of this restriction, no forensic tools are available for the identification of the meat. We describe an efficient method, based on single nucleotide polymorphisms of the cytochrome b gene, that can be used to differentiate biological material derived from paca from those of domestic species commonly used as sources of meat. The identification of the presence of C. paca in the samples was 100% reliable.

Resumo Paca (Cuniculus paca Linnaeus, 1766) é o segundo maior roedor brasileiro. A qualidade da carne e a forte tradição da caça de subsistência são fatores que contribuem significativamente para o declínio das populações. Apesar da proibição a caça no Brasil, no momento ainda não há ferramentas disponíveis para identificar a carne e seus produtos como prova forense. Neste trabalho propomos um método eficaz de identificação, baseado em polimorfismos de único nucleotídeo no gene Citocromo b, objetivando diferenciar material biológico de paca das espécies domésticas comumente utilizadas como alimento no Brasil. A identificação das amostras de paca foram possíveis em 100% das amostras analisadas.

Proteína bruta e energia metabolizável para codornas de corte de um a 14 dias de idade / Crude protein and metabolizable energy for meat quail from 1 to 14 days of age

Com o objetivo de avaliar diferentes níveis de proteína bruta e de energia metabolizável para codornas de corte de um a 14 dias de idade, foi realizado um estudo utilizando 840 codornas de corte, mistas. As aves foram distribuídas em arranjo fatorial (2x5) constituído por 10 tratamentos (dois níveis de energia metabolizável - 2800 e 3000kcal/kg e cinco níveis de proteína bruta - 22,0; 24,0; 26,0; 28,0 e 30,0por cento), sete repetições com 12 aves cada. Foram avaliados os seguintes parâmetros: consumo de ração, ganho em peso aos sete e 14 dias de idade, conversão alimentar aos 14 dias e viabilidade. Verificou-se que codornas alimentadas com dietas com o nível energético mais baixo, 2800kcal/kg, apresentaram maior consumo. As aves que consumiram ração com menor nível de energia apresentaram maior peso aos sete dias de idade independentemente do nível de proteína bruta utilizado. O peso aos 14 dias de idade apresentou resposta quadrática com o acréscimo de proteína bruta na ração, sendo que dietas contendo 28,86 por cento de PB proporcionaram melhor ganho independentemente do nível de energia utilizado. A conversão alimentar apresentou melhores resultados com o aumento do nível de proteína bruta da ração, independentemente do nível de energia metabolizável utilizado. Não foram observados efeitos significativos dos níveis de proteína e energia ou de sua interação sobre a viabilidade das aves. Rações contendo 30,0 por cento de proteína bruta e 2800 ou 3000kcal/kg de energia metabolizável proporcionam satisfatórios resultados de desempenho para codornas de corte de um a 14 dias de idade...

Aiming to evaluate the effect of different levels of crude protein and metabolizable energy for quails from 1 to 14 days of age, a study was conducted using 840 quails, mixed. The birds were distributed in a factorial arrangement (2x5) consisting of 10 treatments (two levels of metabolizable energy - 2,800 and 3,000kcal/kg and 5 levels of crude protein - 22.0, 24.0, 26.0, 28.0 and 30.0 percent), 7 repetitions with 12 birds each. We evaluated the following parameters: feed intake, weight gain at 7 and 14 days of age, feed conversion at 14 days and viability. It was found that quail fed diets with the lowest energy level, 2,800kcal/kg, showed higher consumption. Birds fed diets with lower energy level had greater weight at 7 days of age regardless of the level of crude protein used. The weight at 14 days of age showed a quadratic response with the addition of crude protein in feed, showing that diets containing 28.86 percent CP provide better gain regardless of the level of energy used. The feed showed better results with the increased level of dietary CP, regardless of level of metabolizable energy used. There were no significant effects of protein and energy levels or their interaction on viability. Diets with 30.0 percent crude protein and 2,800 or 3,000kcal/kg metabolizable energy provide satisfactory performance results for quails from 1 to 14 days of age...

Estimativas de herdabilidades e correlações genéticas entre características reprodutivas em touros da raça Nelore / Genetic correlations and heritability estimates of reproductive traits of Nellore bulls

Foram obtidas estimativas de variância fenotípica, genética e residual, herdabilidades e correlações genéticas para as características reprodutivas em 5.903 animais da raça Nelore. O modelo experimental utilizado foi o método de máxima verossimilhança restrita livre de derivadas. Os valores de herdabilidade foram de 0,24±0,05 para perímetro escrotal aos 450 dias de idade e de 0,37±0,05 aos 21 meses de idade, na ocasião do exame andrológico; de 0,24±0,05 e 0,26±0,05 para comprimento dos testículos esquerdo e direito; de 0,29±0,05 e 0,31±0,05 para largura dos testículos esquerdo e direito; de 0,12±0,04 para formato testicular; de 0,33±0,06 para volume testicular; de 0,11±0,03 para turbilhonamento; de 0,08±0,03 para motilidade e de 0,05±0,02 para vigor espermático; de 0,20±0,04, 0,03±0,02 e 0,19±0,04 para defeitos espermáticos maiores, menores e totais, respectivamente. As características biométricas testiculares apresentaram valores de herdabilidade moderados a altos, enquanto as características seminais valores baixos. Correlações genéticas entre perímetro escrotal com todas as características reprodutivas foram favoráveis, o que sugere o perímetro escrotal como característica de escolha na seleção de touros.

Estimates of phenotypic, genetics and residual variances for reproductive traits in 5903 Nellore bulls were obtained. The experimental model used was multiple trait derivative-free restricted maximum likelihood. The values obtained for heritability were 0.24±0.05 for scrotal circumference at 450 days of age and 0.37±0.05 at 21 months for age at the time of the breeding soundness evaluation; 0.24±0.05 and 0.26±0.05 for left and right testicle length; 0.29±0.05 and 0.31±0.05 for left and right testicle width; 0.12±0.04 for testicle format; 0.33±0.06 for testicle volume; 0.11±0.03 for gross motility; 0.08±0.03 for individual motility and 0.05±0.02 for spermatic vigor; 0.20±0.04, 0.03±0.02 and 0.19±0.04 for larger defects, smaller defects and total defects, respectively. The values for heritability for testicular biometric characteristics were moderate to high while the seminal characteristics, presented low values. Genetic correlations between scrotal circumference with all the reproductive traits were favorable, suggesting the scrotal circumference as a feature of choice in the selection of bulls.

Inclusão da epistasia em modelo de avaliação genética de bovinos de corte compostos / The effect of the inclusion of epistasis on the genetic evaluation model of beef cattle composite

Dados de bovinos compostos foram analisados para avaliar o efeito da epistasia nos modelos de avaliação genética. As características analisadas foram os pesos aos 205 (P205) e 390 dias (P390) e perímetro escrotal aos 390 dias (PE390). As análises foram realizadas pela metodologia de máxima verossimilhança considerando-se dois modelos: o modelo 1 incluiu como covariáveis os efeitos aditivos diretos e maternos, e os não aditivos das heterozigoses para os efeitos diretos e para o materno total, e o modelo 2 considerou também o efeito direto de epistasia. Para comparação dos modelos, foram utilizados o critério de informação de Akaike (AIC) e o critério de informação Bayesiano de Schwartz (BIC), e o teste de razão de verossimilhança. A inclusão da epistasia no modelo de avaliação genética pouco alterou as estimativas de componentes de (co)variâncias genéticas aditivas e, consequentemente, as herdabilidades. O teste de verossimilhança e o critério de Akaike sugeriram que o modelo 2, que inclui a epistasia, apresentou maior aderência aos dados para todas as características analisadas. O critério BIC indicou este modelo como o melhor apenas para P205. Para análise genética dessa população, o modelo que considerou o efeito de epistasia foi o mais adequado.

Composite bovine data was analyzed with the objective of evaluating the effect of the epistasis parameter in the models of genetic evaluation. The analyzed characteristics were weight at 205 (W205) and 390 days (P390), and scrotal circumference at 390 days (SC390). The analysis were done by the maximum likelihood method, considering two models: model 1, which included as covariates the direct and maternal additive effects, and non-additive of the heterozygosis for the direct and total maternal, and model 2, which also considered the direct epistasis direct. The Akaike Information Criteria (AIC) and the Bayesiano of Schwartz Information Criteria (BIC) were used for the comparison of the models and the test of ratio of likelihood. The inclusion of the epistasis effects on the model of the genetic evaluation did not alter much the estimation of the genetic additive (co)variances components and, consequently the heritability. However, it was significantly superior by the likelihood ratio test for the studied characteristics. Through the BIC, model 2 was more adequate only for W205. For the genetic analysis of that population the model that considers the epitasis is the more adequate.

Efeito da autocorrelação residual na avaliação genética de cabras para a produção de leite e para o formato da curva de lactação / Effect of residual autocorrelation in the genetic evaluation of goats for milk yield and the shape of the lactation curve

Avaliou-se o efeito da autocorrelação residual sobre a qualidade das estimativas dos parâmetros genéticos para produção total de leite (PL) e para os coeficientes a, b e c do modelo de Wood e, consequentemente, sobre a classificação dos animais para estas características. O modelo de Wood foi ajustado às lactações de cabras considerando-se três situações de estrutura residual: (EI) - erros independentes, (AR1) - erros autorregressivos de primeira ordem e (EI - AR1) - erros AR1 somente para as lactações que apresentaram autocorrelação residual significativa e EI para as demais. As estimativas dos coeficientes a, b e c e PL foram utilizadas como variáveis dependentes em um modelo animal multicaracterístico, o qual incluiu os efeitos aleatórios de animal e de ambiente permanente e os efeitos fixos de grupo contemporâneo, número de crias por parto, grupos genéticos e ordem de parto, além das covariáveis duração da lactação e a idade da cabra ao parto. As diferentes estruturas residuais afetaram as estimativas dos parâmetros genéticos e as classificações dos animais para as características estudadas. Portanto, a seleção dos animais pode ser modificada pela presença da autocorrelação residual, sendo a estrutura EI-AR1 uma alternativa para contornar este problema.

The objective of this study was to evaluate the residual autocorrelation effect on the estimates of genetic parameters for total milk yield (MY) and the coefficients a, b and c of Wood's model and, consequently, the animal's classification for these traits. Wood's model was fitted to the lactation of goats considering three cases of residual structure: (IE) - independent errors, (AR1) - first order autoregressive errors, and (IE - AR1) - AR1 errors only for lactations that had significant residual autocorrelation and IE for others. Estimates of the coefficients a, b and c and PL were used as dependent variables in a multivariate animal model, which included the random effects of animal and permanent environmental and fixed effects of contemporary group, number of foals per birth, genetic groups and order of calving, besides the covariates of lactation length (linear) and age at parturition (linear and quadratic). The different residual structures affected the estimates of genetic parameters and the classification of animals for the traits studied. Therefore, the selection of animals can be modified with the presence of residual autocorrelation and the structure IE-AR1 is presented as an alternative to solve this problem.

Efeito da interação grupo genético x nível de lisina sobre características de desempenho de codornas Coturnix coturnix de corte no período de crescimento / Genotype by lysine level interaction on performance traits of meat type quail Coturnix coturnix during the growing period

Estudou-se o efeito da interação entre grupo genético e nível de lisina sobre características de desempenho de 576 codornas de corte, de ambos os sexos, de dois grupos genéticos (EV1 e EV2), alimentadas com dietas contendo seis níveis de lisina total, 1,4; 1,5; 1,6; 1,7; 1,8 e 1,9 por cento, no período de crescimento, em esquema fatorial 6x2 e delineamento inteiramente ao acaso, sendo quatro repetições de 12 codornas por unidade experimental. Avaliaram-se o ganho de peso (g), o peso (g), o consumo de ração (g/ave) e a conversão alimentar (g de dieta/g de peso) nos períodos inicial - do nascimento ao 21dia - e total - do nascimento ao 42 dia de idade - de crescimento. Houve efeito significativo da interação grupo genético x nível de lisina total da dieta sobre todas as variáveis de desempenho avaliadas no 21º e no 42º dia de idade. No período inicial, ganhos máximos de peso das codornas dos grupos genéticos EV1 e EV2 foram observados nos tratamentos com níveis de 1,7 e 1,7 por cento de lisina total na dieta. Do nascimento ao 42dia de idade, ganhos máximos de peso foram estimados para codornas dos grupos EV1 e EV2 em dietas que continham 1,6 e 1,6 por cento de lisina total.

The effects of genotype by lysine level interaction on performance traits of meat type quails during the growing period of five hundred seventy-six meat type quails of both genders, from two genetic groups (EV1 and EV2), were evaluated in a completely randomized experimental design with six different levels of total lysine (1.4; 1.5; 1.6; 1.7; 1.8, and 1.9 percent), and four replicates of 12 quails per experimental unit. The recorded traits for each experimental period (from hatching to the 21st day and from hatching to the 42nd day of age), were: body weight (g), weight gain (g), feed intake (g), and feed: weight gain ratio (g/g). Significant effects of genotype by lysine interaction were observed on all the performance traits evaluated in both periods. The total lysine requirements from hatching to the 21st day of age and from hatching to 42 days of age for EV1 and EV2 lines were 1.7 and 1.7 percent and 1.6 and 1.6 percent, respectively.

Efeito dos genótipos para alphaS1-caseína sobre as frações proteicas e lipídicas do leite de cabra / Effect of genotypes for alphaS1-casein on proteic and lipidic fractions in goat milk

O alto polimorfismo encontrado no lócus do gene da αS1-caseína em caprinos, classificado em quatro níveis de expressão - alto, médio, baixo e nulo -, está associado à produção de 3,6; 1,6; 0,6 e 0g/L/alelo, respectivamente. O estudo foi realizado para investigar possíveis variações na produção de leite e seus constituintes, no perfil de caseínas e na lipólise da gordura. Quarenta e quatro cabras foram distribuídas em cinco genótipos: dois homozigotos, um para alta (AA) e outro para produção intermediária (EE), e três heterozigotos chamados AE, AF e EF, para αs1-caseína. Para a lipólise, o leite foi subamostrado em quatro alíquotas que sofreram tratamento térmico no momento da ordenha e após 24h de resfriamento. Diferenças entre genótipos foram observadas para a produção de caseína e de suas frações. As demais variáveis não diferiram entre genótipos. O genótipo AA apresentou os maiores conteúdos de caseína (28,6g/L) e de αS1-cn (22,3 por cento). Os demais genótipos apresentaram média de 20,4g/L. Os grupos AE e AF apresentaram média de 12,1, EE-10,1 e EF-9,1 por cento de αS1-cn. O resfriamento do leite por 24 horas aumentou a taxa de lipólise no leite. A genotipagem das cabras para αS1-cn pode ser usada como ferramenta de seleção com objetivo de obter produtos lácteos com distintos perfis de proteínas.

A high polymorphism is found in the locus of goat αS1-casein gene and it is classified in four levels of expression, named high, medium, and low, associated with production of 3.6, 1.6, 0.6, and 0 g/L/allele, respectively. The study was conducted to investigate possible variations on milk yield and components, profile of casein, and lipolysis of fat. Forty-four goats were assigned to five distinct genotypes as two homozygous, one for high (AA) and the other for intermediate yield (EE); and three heterozygous named AE, AF, and EF for the αs1-casein. For lipolysis, milk was sampled in four aliquots which were treated soon after milking and 24 hours after cooling. Differences were observed for both casein yield and its fractions. No difference was found for other variables. The AA genotype presented the higher content of both casein (28.6g/L) and αS1-cn (22.3 percent). Other genotypes averaged 20.4g/L for casein content. Values of αS1-cn were 12.1 percent for heterozygous and 10.1 and 9.1 percent for both EE and EF genotype respectively. Cooling the milk for 24 hours increased the rate of lipolysis. Genotyping goats for the αS1-cn can be used as a tool for selecting animal targeting milk products with distinct profiles of proteins.

Avaliação de características de desempenho e de carcaça de codornas de corte por meio da análise de componentes principais / Evaluation of production and carcass traits of meat - type quails by principal components analysis

Foram utilizados dados de 288 codornas de corte (Coturnix coturnix coturnix) para avaliar a possibilidade de resumir a informação contida no complexo de variáveis originais, eliminando-se variáveis inexpressivas por meio da técnica de componentes principais. Foram registrados o peso vivo (PVIVO) e pesos do peito (PPEITO), das coxas (PCOXA), da gordura abdominal (GA), das vísceras comestíveis (fígado, moela e coração) (FIG, MOELA e CORA) e da carcaça eviscerada (PCEVIS). As carcaças foram secas e trituradas para a avaliação do teor matéria seca (MS), gordura (GORD) e proteína bruta (PB). Dos 11 componentes principais, sete (63,6 por cento) apresentaram variância menor que 0,7 (autovalor inferior a 0,7), sendo sugeridas para descarte, respectivamente, em ordem de menor importância, para explicar a variação total das seguintes variáveis: PCEVIS, PPEITO, PCOXA, CORA, FIG MOELA e GORD. Com base nos resultados, recomenda-se manter as seguintes variáveis em experimentos futuros: PVIVO, MS, PB e GA.

Records on 288 meat type quails (Coturnix coturnix coturnix) were used to identify independent and informative variables by eliminating inexpressive variables by means of principal component analysis. The following performance traits were recorded: live body weight (LBW), eviscerated carcass weight (CW), whole leg weight (WLW), breast weight (BW), abdominal fat pad weight (FW), and giblets weight (liver, gizzard, and heart) (LIW, GW, and HW). The carcasses were also dried and grounded to evaluate dry matter (DM), fat (FA,T) and crude protein (CP) contents. Out of 11 principal components, seven (63.6 percent) showed variance lower than 0.7 (eigenvalue lower than 0.7). The following traits were discarded because they showed inexpressive contribuitions for the total variation: CW, BW, WLW, HW, LIW, GW, and FAT. Based on the results, it is recommended to record the following variables in future experiments: LBW, DM, CP, and FW.

Estudo de características de produção de matrizes de corte por meio da análise de componentes principais / Study of meat-type chickens production traits by principal components analysis

Avaliou-se o descarte de variáveis de produção, em análises de componentes principais, de três linhagens de matrizes de corte do Programa de Melhoramento Genético da Universidade Federal de Viçosa, utilizando informações de 270 aves, sendo 90 de cada linhagem. As características analisadas foram dias para postura do primeiro ovo (DPPO), taxa de postura da 22ª a 56ª semana (TP), peso médio individual na 32ª (PMI1), na 40ª (PMI2), na 48ª (PMI3), na 56ª (PMI4) e na 64ª semana (PMI5) e peso médio do ovo, obtido pela média da pesagem de três ovos na 32ª (PMO1), na 40ª (PMO2), na 48ª (PMO3), na 56ª (PMO4) e na 64ª semana (PMO5). Dos 12 componentes principais, sete apresentaram variância menor do que 0,7 (autovalor menor do que 0,7), sugerindo-se sete variáveis para descarte. As variáveis descartadas foram aquelas que apresentaram maiores coeficientes, em valor absoluto, a partir do último componente principal. Observou-se correlação linear simples e significativa entre as variáveis descartadas e as não descartadas, que indica redundância de variáveis, razão do descarte. Recomendam-se as variáveis: DPPO, TP, PM14, PMO1 e PMO4 para o estudo de características da produção de matrizes de frango de corte por meio da análise de componentes principais.

Records of 270 meat-type chickens from three lines, 90 of each one, were used to discard variables in a principal component analysis. Data were obtained from meat-type chicken lines of the genetic breeding program of the Universidade Federal de Viçosa. The following traits were evaluated: days at first egg (DFE), egg production rate (EPR) from 22nd to 56th week, body weights at 32nd (BW1), 40th (BW2), 48th (BW3), 56th (BW4), and 64th weeks of age (BW5), and average of three egg weights, at 32nd (EW1), 40th (EW2), 48th (EW3), 56th (EW4) and at 64th weeks (EW5). From the 12 principal components, seven showed variance lower than 0,7 (eigenvalue lower than 0,7), suggesting seven variables to be discarded. Variables which showed the highest coefficients, in absolute value, in the last principal component were discarded. Highly correlated variables with the smaller principal components variance explain a small part of the whole variation. In addition, discarded variables in function of the significant simple linear correlation with the nondiscorded variable, were considered redundants. The variables DFE, EPR, BW4, EW1, and EW4 are recommended for principal component analysis of broiler matrix.

Exigências em proteína bruta para codornas de corte EV1 em crescimento / Crude protein requirements for EV1 meat type quail during the growing period

Estudou-se a exigência de proteína bruta para a linha EV1 de codornas de corte na fase de crescimento utilizando-se 288 aves, de ambos os sexos, em delineamento experimental inteiramente ao acaso, cujos tratamentos foram dietas com seis níveis proteína bruta, 23, 25, 27, 29, 31 e 33 por cento, e quatro repetições de 12 codornas por unidade experimental. Nos períodos de estudo - inicial (do nascimento ao 21º dia) e total (do nascimento ao 42º dia de idade) - foram registrados o peso corporal (g), o ganho de peso (g), o consumo de ração (g) e a conversão alimentar (g de ração/g de peso). No período inicial houve efeito quadrático do nível de proteína da dieta sobre peso corporal, ganho de peso e consumo alimentar, com máximo desempenho nos níveis de 30,2; 30,1; e 30,8 por cento, respectivamente. Efeito quadrático significativo foi observado no peso no 42º dia de idade, com pico máximo em 30,2 por cento de proteína bruta. Do nascimento ao 42º dia de idade, observou-se efeito quadrático do nível de proteína bruta sobre o ganho de peso e o consumo alimentar, com ponto de máximo para ganho de peso em 29,5 e maior consumo em 32,6 por cento de PB. Houve efeito linear significativo do nível protéico sobre a conversão alimentar. A exigência de proteína bruta para o máximo ganho de peso de codornas de corte em crescimento do nascimento ao 21º dia de idade foi estimada em 30,1 por cento e do nascimento ao 42º dia, em 29,4 por cento da dieta

Crude protein requirements for EV1 meat type quails were estimated using 288 quails of both sexes in a completely randomized experimental design with six crude protein levels (23, 25, 27, 29, 31 and 32 percent) and four replicates of 12 quails per experimental unit. The following traits were recorded in each experimental period (from hatch to 21 days and from hatch to 42 days of age): body weight (g), weight gain (g), feed intake (g), and feed:weight gain ratio. From hatch to 21 days of age quadratic effects of crude protein levels on live body weight, weight gain and feed intake were observed and maximum performances were estimated for quails fed 30.2; 30.1; and 30.8 percent crude protein diets, respectively. Quadratic effect of protein level on body weight at 42 days of age was significant and quails fed 30.2 percent crude protein diets showed maximum performance. Quails fed 29.5 and 32.6 percent crude protein diets from hatch to 42 days showed maximum weight gain and feed intake while feed:weight gain ratio was negative and linearly related to crude protein level of diet. Crude protein requirement for weight gain (male and female), from hatch to 21 days of age is estimated in 30.1 percent and from hatch to 42 days of age in 29.5 percent

Exigência de proteína bruta e energia metabolizável para codornas de corte EV1 / Crude protein and metabolizable energy requirements for EV1 meat type quail line

Estudou-se a exigência de proteína bruta e energia metabolizável para codornas européias EV1, durante três períodos experimentais, 7-21, 22-42 e 7-42 dias de idade, utilizando-se 576 aves, de ambos os sexos. O delineamento experimental foi inteiramente ao acaso, em arranjo fatorial 4 x 2, quatro níveis de proteína bruta (22, 24, 26 e 28 por cento de PB) e dois níveis de energia (2900 e 3100kcal de EM/kg de ração), com seis repetições de 12 codornas por unidade experimental. O peso corporal e o ganho de peso do sétimo ao 21º dia de idade foram influenciados de forma quadrática pelo nível protéico da dieta. O consumo alimentar diminuiu linearmente com o aumento do nível energético. A conversão alimentar aumentou com o aumento da PB e reduziu com o aumento do nível de EM. O peso corporal no 42º dia, o ganho de peso e a conversão alimentar (7-42 dias) não foram influenciados pelos níveis de EM e PB das dietas. O nível energético 2900kcal de EM/kg propiciou maior consumo em relação à dieta com 3100kcal de EM/kg. O máximo desempenho das codornas de corte EV1 foi alcançado com dietas formuladas com 27 por cento PB e 2900 kcal de EM/kg no período inicial (sétimo ao 21º dia de idade) e 22 por cento de PB e 2900 kcal de EM/kg durante o período total de criação (sétimo ao 42º dias de idade).

The crude protein and metabolizable energy requirement for weight gain, body weight, feed consumption, and feed consumption : weight gain ratio during three periods (7- 21; 21-42 and 7-42days of age) of the growing phase of meat type quail (EV1) were estimated in a completely randomized design, with eight treatments and six replicates of 12 quails per experimental unit. The treatments consisted in a factorial combination 4 x 2 (22, 24, 26 e 28 percent PB x 2900 e 3100kcal de EM/kg). Body weight and weight gain from 7 to 21 days of age were quadratic affected by protein level of diets. Feed consumption linearly decreased with the increasing of diet energetic level. Feed: weight gain ratio increased linearly with crude protein level and decreased with metabolizable energy level of diets. Body weight at 42 days of age was not affected by metabolizable energy and crude protein levels of the diets. From 7 to 42 days of age the protein and metabolizable energy of diets did not affect quail body weight and feed: weight gain ratio. Quails fed on 2900kcal of EM/kg of diet showed higher feed consumption in comparison to quails fed on 3100kcal of EM/kg diets. Maximum performance of EV1 quails are reached in diets with 27 percent of crude protein (CP) and 2900kcal of ME/kg of diet in the initial period (7-21 days of age) and 22 percent of CP and 2900kcal of ME/kg of diet in the whole period (7-42 days of age).

Ajustamento para heterogeneidade de variâncias para produção de leite e gordura entre rebanhos da raça Pardo-Suíça no Brasil / Adjustment for heterogeneity of variance for milk and fat yield among herds of Brown Swiss in Brazil

Para verificar o efeito da inclusão das interações reprodutor x rebanho e reprodutor x rebanho-ano como fator de ajustamento da heterogeneidade de variância, registros de produção de leite e gordura foram estratificados, com base no desvio-padrão fenotípico da produção de leite ajustada, em duas classes: baixo (<1.280kg) e alto (>1.280kg) desvio-padrão. Três modelos foram utilizados, sem e com interação reprodutor x rebanho e reprodutor x rebanho-ano, em análises de característica única, geral e em cada classe de desvio-padrão. Médias e componentes de variâncias foram maiores na classe de alto desvio-padrão. Na classe de baixo desvio-padrão, a herdabilidade não se alterou com a inclusão dos efeitos de interação no modelo, sendo de 0,34 para produção de leite e de 0,32 para produção de gordura. Na classe de alto desvio-padrão, as herdabilidades foram: 0,37, 0,35 e 0,36, e de 0,35, 0,32 e 0,35, para produção de leite e gordura, nos modelos sem, com interação reprodutor x rebanho e com interação reprodutor x rebanho-ano, respectivamente. A inclusão do efeito de interação reprodutor x rebanho nos modelos foi significativa (P<0,01) para produção de gordura, em análise geral e na classe de alto desvio-padrão, pelo teste da razão de verossimilhança.

In order to verify the effect of including the interactions of sire x herd and the sire x herd-year, as a adjust factor of the variance heterogeneity, registers of milk and fat yields were classified into two classes of standard deviation: low (<1.280kg) and high (>1.280kg), based on phenotypic standard deviation of the milk production adjusted. Three models, without and with interaction of sire x herd and sire x herd-year, were used in the general univariate analyses and in each standard deviation class. Averages and variance components were higher in the high standard deviation. In the class of low standard deviation, heritability didn't alter with the inclusion of the interaction effects in the model, being of 0.34 for milk yield and 0.32 for fat yield. In the class of high standard deviation, heritabilities were: 0.37, 0.35 and 0.36, and of 0.35, 0.32 and 0.35, for milk and fat yield, in the models without and with interaction of sire x herd and with interaction of sire x herd-year, respectively. The inclusion of the interaction of sire x herd was significant (P<0.01) for fat yield, in general analyses and in the high standard deviation class, in the likelihood ratio test.

Exigências de proteína bruta e energia metabolizável em codornas de corte durante a fase de crescimento / Protein and metabolizable energy requirements for meat type quail during the growing phase

Estudou-se a exigência de proteína bruta e energia metabolizável para codornas européias em crescimento, em cinco períodos experimentais, de sete dias cada. Foram utilizadas 384 codornas de ambos os sexos, com sete dias de idade em delineamento experimental utilizado inteiramente ao acaso, em esquema fatorial de 2×4, dois níveis de energia (2900 e 3100kcal de EM/kg de ração) e quatro níveis de proteína (22, 24, 26 e 28 por cento de PB), com seis repetições de oito animais cada. Foram estudadas as variáveis ganho de peso (g), peso acumulado (g), consumo de ração (g) e conversão alimentar (g de ração/g de peso). Observou-se efeito linear dos níveis de proteína no primeiro período e quadrático nos demais períodos sobre o ganho de peso das aves. Os níveis de proteína foram estimados em 28,0 por cento (2900kcal de EM/kg), 25,7 por cento (3100kcal de EM/kg), 27,9 por cento, 24,8 por cento (3100kcal de EM/kg) e 23,1 por cento (2900kcal de EM/kg) para o segundo, terceiro, quarto e quinto período, respectivamente.

Crude protein (CP) and metabolizable energy (ME) levels during five experimental periods of seven days each of the growing phase for European quail were determined. A total of 384 quails of both sexes were used in a completely randomized design in a 2×4 (energy and crude protein) factorial treatment with six replications of eight quails each. The metabolizable energy levels were 2900 and 3000kcal of ME/kg of diet and the crude protein levels were 22, 24, 26 and 28 percent. The analyzed variables were weight gain (g), accumulated weight (g), feed consumption (g), feed:gain ratio (g/g). Performance responses were evaluated by linear and quadratic regression of the traits on crude protein levels. Higher weight gains from the following protein and metabolizable energy levels combinations: 28.0 percent PB and 2900 kcal EM/kg (first period); 25.7 percent CP and 3100kcal ME/kg (second period); 27.9 percent and 2900kcal ME/kg (third period); 24.8 percent PB and 3100kcal/kg (fourth period) and 23.1 percent CP and 2900kcal/kg (fifth period).

Estimação de parâmetros genéticos para características de crescimento de ovinos Santa Inês utilizando modelos uni e multicaracterísticas / Estimation of genetic parameters for growth traits of Santa Inês sheep using single and multiple-trait models

Utilizaram-se registros de pesos do nascimento aos 196 dias de idade de 927 cordeiros, filhos de 45 reprodutores e 323 matrizes de ovinos da raça Santa Inês, controlados de 1983 a 2000, com o objetivo de avaliar três modelos que consideraram ou não o efeito genético materno e a (co)variância entre os efeitos genéticos direto e materno, para estimar componentes de variância e parâmetros genéticos por meio de modelos uni e bicaracterísticas. Os componentes de (co)variâncias e os parâmetros genéticos direto e materno para os pesos foram estimados pelo método da máxima verossimilhança restrita, sob modelo animal. De acordo com o teste de razão de verossimilhança, o modelo que incluiu o efeito aditivo direto mais o efeito materno foi o indicado para todas as características estudadas. A não-inclusão do efeito materno no modelo de análise superestimou as variâncias e as herdabilidades para o efeito direto (0,56 a 0,23). A importância do efeito materno diminuiu ao longo da trajetória de crescimento, à medida que a idade dos cordeiros aumentava. As variâncias e as herdabilidades estimadas por meio dos modelos bicaracterísticas para os efeitos genéticos diretos foram superiores às obtidas pelos modelos unicaracterísticas. As correlações genéticas entre as características foram altas e positivas. O efeito materno foi importante para todas as características estudadas, devendo, portanto, ser considerado nos estudos de crescimento. Os modelos bicaracterísticas possibilitaram resgatar parte da variância aditiva direta, levando a estimativas maiores de herdabilidade.

Records of birth weights at 196 days of age of 927 lamb progenies of 45 sires and 323 dams of Santa Ines sheep, controlled from 1983 to 2000, were used with purpose of evaluating three models that considered or no the maternal genetic effect and covariance between direct and maternal genetic effects, to estimate variance components and genetic parameters by single and two-trait analyses. The (co)variance components and genetic direct and maternal parameters were estimated by restricted maximum likelihood methods, under animal model. The model that included additive direct and maternal effects showed higher value for log likelihood for all the studied traits. Model without maternal effect overestimated the variances and heritability for direct genetic effect (0.56 to 0.23). The importance of maternal effect decreased with growth, as the age of the lambs increased. The variances and heritability estimates in two-trait models for genetic direct genetic effect were higher than those obtained by single-trait models. The genetic correlations between the traits were high and positive. The maternal effect was important for all the studied traits. The two-trait models allowed better estimate of the direct additive variance, causing higher heritability value.

Estimação de tendência genética para produção de leite na raça Holandesa no estado de Minas Gerais / Estimate of genetic trend for milk production in Holstein in the State of Minas Gerais

Utilizaram-se 75.567 registros de produção de leite, de 40.941 vacas da raça Holandesa, distribuídos em 561 rebanhos e obtidos no período de 1980 a 2002. Valores genéticos de vacas e touros, obtidos por meio de modelo animal, foram usados para estimação de tendências genéticas, considerando-se as quatro trilhas de seleção conectando duas gerações. Estimativas de componentes de variância e valores genéticos previstos foram obtidos por meio do sistema MTDFREML. O modelo de análise incluiu os efeitos fixos de rebanho-ano-estação de parto, grupo genético, idade da vaca ao parto como covariável (efeitos linear e quadrático) e os efeitos aleatórios de animal, permanente de meio e erro. O maior valor de ganho genético anual, 57,7kg/ano, foi para a trilha touros pais de touros no período de 1986 a 1991. Para a trilha vacas mães de touros, os valores foram negativos e para vacas mães de vacas passou de negativo de 1970 a 1985 para 16,9kg/ano, de 1986 a 1999. Quando as trilhas de seleção foram combinadas, o ganho genético anual estimado no período 1970 a 1999 foi 6,71± 3,78kg, correspondendo a 0,1 por cento da média. As estimativas de tendência genética obtidas estão muito aquém do teoricamente possível.

Production records from 75,567 lactations of 40,941 Holstein cows in 561 herds from 1980 to 2002 were used. Predicted cow and sire breeding values from an animal model were used to estimate genetic trend considering the four selection paths connecting two generations. The variance component estimates and breeding value predictions were obtained using the MTDFREML program package. The model of analysis accounted for the fixed effects of herd-year-season of calving, genetic group, age of calving as covariate (linear and quadratic) and the random effects of animal, permanent environment and error. The greatest annual genetic gain estimate was 57.7kg/yr for the path of sires of bulls from 1986 to 1991. For the path of dams of bulls, estimates were negative and for dams of cows changed from negative from 1970 to 1985 to 16.9kg/yr, from 1986 to 1999. When all paths of selection were combined, estimated annual genetic gain from 1970 to 1999 was 6.71± 3.78kg, corresponding to 0.1 percent of the average production. Estimates of genetic trend were much less than theoretically possible.

Estimação de parâmetros genéticos para características de crescimento de ovinos Santa Inês utilizando modelos uni e multicaracterísticas / Estimation of genetic parameters for growth traits of Santa Inês sheep using single and multiple-trait models

Utilizaram-se registros de pesos do nascimento aos 196 dias de idade de 927 cordeiros, filhos de 45 reprodutores e 323 matrizes de ovinos da raça Santa Inês, controlados de 1983 a 2000, com o objetivo de avaliar três modelos que consideraram ou não o efeito genético materno e a (co)variância entre os efeitos genéticos direto e materno, para estimar componentes de variância e parâmetros genéticos por meio de modelos uni e bicaracterísticas. Os componentes de (co)variâncias e os parâmetros genéticos direto e materno para os pesos foram estimados pelo método da máxima verossimilhança restrita, sob modelo animal. De acordo com o teste de razão de verossimilhança, o modelo que incluiu o efeito aditivo direto mais o efeito materno foi o indicado para todas as características estudadas. A não-inclusão do efeito materno no modelo de análise superestimou as variâncias e as herdabilidades para o efeito direto (0,56 a 0,23). A importância do efeito materno diminuiu ao longo da trajetória de crescimento, à medida que a idade dos cordeiros aumentava. As variâncias e as herdabilidades estimadas por meio dos modelos bicaracterísticas para os efeitos genéticos diretos foram superiores às obtidas pelos modelos unicaracterísticas. As correlações genéticas entre as características foram altas e positivas. O efeito materno foi importante para todas as características estudadas, devendo, portanto, ser considerado nos estudos de crescimento. Os modelos bicaracterísticas possibilitaram resgatar parte da variância aditiva direta, levando a estimativas maiores de herdabilidade.

Records of birth weights at 196 days of age of 927 lamb progenies of 45 sires and 323 dams of Santa Ines sheep, controlled from 1983 to 2000, were used with purpose of evaluating three models that considered or no the maternal genetic effect and covariance between direct and maternal genetic effects, to estimate variance components and genetic parameters by single and two-trait analyses. The (co)variance components and genetic direct and maternal parameters were estimated by restricted maximum likelihood methods, under animal model. The model that included additive direct and maternal effects showed higher value for log likelihood for all the studied traits. Model without maternal effect overestimated the variances and heritability for direct genetic effect (0.56 to 0.23). The importance of maternal effect decreased with growth, as the age of the lambs increased. The variances and heritability estimates in two-trait models for genetic direct genetic effect were higher than those obtained by single-trait models. The genetic correlations between the traits were high and positive. The maternal effect was important for all the studied traits. The two-trait models allowed better estimate of the direct additive variance, causing higher heritability value.

Simulação de dados para avaliação genética de rebanhos de gado de corte / Genetic evaluation of beef cattle herds through simulated data

Utilizou-se o programa GENESYS para simular rebanhos de gado de corte selecionados, durante cinco gerações, por meio da seleção individual ou seleção com base no melhor preditor linear não-viesado (BLUP). Foram comparados os valores fenotípicos médios e a endogamia média, resultantes da aplicação desses métodos. A característica quantitativa simulada foi o ganho de peso diário, com fenótipo médio inicial de 1kg e herdabilidade de 0,35. Os valores da razão sexual nas populações de seleção foram de 1:50 e 1:25 (macho: fêmeas), correspondendo aos tamanhos efetivos da população de 23,53 e 57,69 animais, respectivamente. Os ganhos genéticos individuais foram maiores para a seleção baseada no BLUP, atribuídos à sua mais alta acurácia na predição dos valores genéticos. Considerando-se cada método de seleção, não houve diferenças significativas entre os dois tamanhos efetivos quanto aos valores fenotípicos médios por geração. A endogamia média aumentou em ambos os métodos de seleção e tamanhos efetivos. Maior aumento e oscilação nos valores ocorreram para a seleção baseada no BLUP no menor tamanho. Embora a seleção tenha sido realizada por pequeno número de gerações, os resultados permitiam discriminar as combinações que proporcionaram maior incremento de endogamia.

The program GENESYS was utilized to simulate herds of beef cattle selected, for five generations, by individual selection or selection based on best linear unbiased prediction (BLUP). Average phenotypic values and inbreeding average of simulated animals from these methods were compared. The simulated quantitative trait was daily weight gain with average initial phenotypic value of 1kg and heritability of .35. The values of sexual ratio in the selection populations were 1:50 and 1:25 (male: females), corresponding to effective population sizes of 23.53 and 57.69 animals, respectively. The individual genetic gains were larger for animals under BLUP selection as a result of higher accuracy of the predicted genetic values. No significant difference between the effective population sizes for average phenotypic values by generation within each selection method was found. The inbreeding coefficient increased within both selection methods and effective sizes. Larger increase and oscillation were observed for selection based on BLUP in the population with smaller effective size. Although a short term selection program was simulated, the results allowed to discriminate combinations which resulted in larger inbreeding increment.